Coolakov (coolakov.ru/tools/razbivka/) — бесплатно можно разгруппировать по кластерам до 500 запросов. Интерфейс до невозможности прост: указываем интересующий нас регион, список ключевых слов и порог кластеризации — чем ниже порог, тем точнее кластеризация у вас в итоге будет.

Разбивка запросов на группы производится на основе схожести ТОП-10 Яндекса. Результат кластеризации можно выгрузить в excel.) — бесплатно можно разгруппировать по кластерам до 500 запросов.

Кластеризатор от seoquick (seoquick.com.ua/keyword-grouping/) — бесплатно можно кластеризовать до 20 тыс. слов, не более 5 тыс. за одну проверку. Интерфейс интуитивно понятен: ключевые слова можно загрузить файлом или указать вручную.

Есть возможность дополнительно указать слова, которые можно считать как одну фразу, минус-слова в широком и точном соответствии, список стоп-слов, синонимы. А также можно выбрать частотность, от которой и будет зависеть тип кластеризации.

Из плюсов: учёт геозависимости и расширенные кластеры для семантики – позволяют распределять некластеризованные слова в наиболее подходящие группы.

Кластеризатор от majento (majento.ru/index.php?page=seo-analize/klasterization/index) — онлайн кластеризатор, за раз можно разгруппировать до 250 запросов незарегистрированным пользователям и до 500 зарегистрированным. Предлагается два метода кластеризации — Soft и Hard. Интерфейс очень простой.

Если указать свой сайт, в результате можно для каждого кластера получить релевантную страницу. Отчёт можно скачать в csv.

KeyClusterer (keyclusterer.ru) — бесплатный десктопный кластеризатор, есть версия для Windows XP/2003/Vista/7-10.
Кластеризацию можно проводить методами hard (более точная) и soft. После автоматической кластеризации вы можете в ручном режиме сгруппировать кластеры в нужные вам папки. На первый взгляд интерфейс может показаться сложным, но по сути для успешной кластеризации внести нужно ровно такие же данные, что и для предыдущего сервиса: ключевые слова, регион, порог кластеризации.

Из плюсов: кластеризация семантического ядра любых размеров, быстрая скорость и точность кластеризации, возможность использования списка стоп-слов для манипуляции ключевыми запросами, указание списка стоп-доменов, которые не будут учитываться при разбивке ключей на группы. Результат кластеризации можно выгрузить в excel.

KeyAssort (keyassort.com) — кластеризатор платный, но есть бесплатная демо-версия без экспорта результатов. В настройках можно выбрать поисковую систему – Яндекс или Google, указать силу группировки (от 1 до 100) и вид кластеризации (софт, мидл или хард), исключить сервисы и отдельные URL, которые не нужно учитывать при кластеризации, выбрать глубину ТОПа – от ТОП-5 до ТОП-50.
Результат также можно корректировать, создавая группы вручную при ручной добивке и экспортировать уже готовое семантическое ядро.