Ссылки на 404 страницы не могут передать вес (либо оказать негативное влияние), т.к. цепочка нарушена. Но домены с низким DR не всегда являются некачественными донорами. Для начала, нужно детальнее проанализировать качество сайтов-доноров

Если доноры, ведущие ссылки на 404 страницы — спамные, то можно ничего не делать.

Если донор не спамный и актуален, косвенно пересекается с вашим сайтом по тематике и региону, обладает трастовостью и содержит качественный контент, то можно настроить 301 редирект на актуальную страницу вашего сайта.
В таком случае есть вероятность получить ссылочный вес на сайт. Однако, стоит отслеживать динамику и в случае возникновения подозрения, что ссылки негативно отражаются на показателях, избавляться от них

Следует понимать, что если у сайта авторитетный домен и хороший ссылочный профиль, то небольшое количество некачественных внешних ссылок не испортят общую ссылочную картину.

Лучший способ бороться с некачественными ссылками — наращивать новые качественные