Нужно убедиться в том, что именно накрутка ПФ является причиной выпадания из индекса

Как распознать негативную накрутку:

• на сайте наблюдался резкий рост прямых заходов
  
• резкий рост трафика из подозрительных подсетей и нецелевых регионов
  
• резко ухудшились поведенческие метрики и выросли отказы
  
• увеличилась роботность
  

Если вышеперечисленные пункты выполняются и видимость обвалилась почти в ноль, скорее всего на сайт действительно наложены санкции

Если, сайт относительно молодой, переехать на новый домен имеет смысл, склеив его со старым 301 редиректом (санкции при склейке не передаются). Однако в большинстве случаев, особенно если речь идет о трастовом старом сайте, стоит не торопиться и подождать, бороться за него.

В первую очередь, стоит попытаться написать в техподдержку Яндекса и доказать, что накруткой занимались ваши конкуренты

Далее, необходимо заняться улучшением поведенческих показателей на сайте, а именно, привлекать «хороший» трафик из поиска. К примеру, с помощью контекстной рекламы.

Параллельно стоит заняться проработкой юзабилити и качества сайта в целом и по разделам, чтобы улучшить естественные пользовательские показатели.

Сюда входит: смена дизайна, улучшение текстов, проработка структуры, добавление новых полезных блоков и функционала.

При этом, нужно регулярно писать в Яндекс с указанием всех улучшений на сайте и просьбой пересмотреть санкции

На будущее - использовать следующие методы защиты от ботового трафика:

• вручную блокируем подозрительные IP
  
• приобрести готовые базы спам-листов
  
• установить Cloudflare
  
• установить reCAPTCHA
  

Полностью от негативной накрутки это не защитит, но уменьшит ее интенсивность.

Также стоит понимать, что чем лучше у сайта поведенческие показатели, тем меньше вероятность обвала вследствие негативной накрутки в будущем

Если, всё же переезжаете на новый домен, следует придерживаться следующего алгоритма:

• подготовить новый домен и указать для него DNS-серверы
  
• настроить и проверить 301 редирект
  
• сообщить о переезде в Я.Вебмастере и GSC
  
• когда старый домен перестанет отображаться в поиске, закрыть его от индексации (удалять нежелательно)
  

После переезда следует отслеживать, не возникают ли ошибки в панелях вебмастеров, а также не забыть перенести счетчики Яндекса и Google на новый сайт